Президиум Фонда содействия развитию технологий и инфраструктуры интернет является высшим коллегиальным-органом управления Фонда. Президиум осуществляет общее руководство деятельностью Фонда. Основной функцией Президиума является обеспечение соблюдения Фондом целей, в интересах которых он был создан.

Порядок формирования Президиума: при создании Фонда первый состав Президиума формируется Учредителем, в дальнейшем состав Президиума формируется Президиумом Фонда. Члены Президиума избираются сроком на пять лет. Количественный состав Президиума определяется по решению Президиума, но не должен превышать десяти человек. Члены Президиума выполняют свои обязанности в Президиуме на добровольной основе.

Руководство текущей деятельностью Фонда осуществляется Президентом Фонда, избираемым первоначально Учредителем Фонда, а в дальнейшем Президиумом сроком на пять лет.